新区采用开发区管委会统一管理的模式。
以湛江经济技术开发区管委会开发控制主体；以土地开发企业（土地开发商）为开发实施主体。其中开发控制主体（即开发区管委会）的主要任务包括：启动资金的筹措，土地一级开发的准备与监督、土地出让金的收取，土地利用的监督与管理的责任。同时要设立土地开发基金，采取自我积累和自我保护的方式，实现滚动式开发。
采用“滚动建设、开发一片、建成一片、收益一片”的方法，以港口的开发建设促进东海岛新区的基础设施建设，同时招商建厂，并随着企业的建成投产，形成税收，用于下一步的市政基础设施建设和土地征用开发。
在开发过程中可灵活运用如下投资、融资方式：
（1）现金投入，由相关入股企业投入现金作为开发公司资本金。
（2）非土地实物资产抵押贷款，以各入股企业所投入非土地实物资产为抵押，向银行贷款。
（3）土地资产开发融资，在统一规划的前提下，可采用多种方式进行土地融资。
（4）熟地转让收益，将已整治的土地向进入开发区的企业转让。
（5）土地抵押贷款，利用所投入的土地作抵押，申请贷款。
（6）采用B-O-T（建设—营运—移交）模式，将区内部分基础设施建设项目交由专业厂家建设、营运，一定年限后，基础设施产权无偿转让给开发区。
（7）新区内企业自行整治。根据入驻企业的实际用地规模，将未整治的土地按一定的价格交由企业自行整治，减少开发公司的投入。
（8）进入资本市场融资，当开发公司设立并正常运转后，即可考虑上市融资，其方式有直接上市和买壳（借壳）上市两种。目前，从上市成本考虑，可以采取买壳上市方式。
（1）总体规划批准后，积极组织下一层次控制性详细规划及重点地段城市设计，为规划管理提供主要依据。
（2）在总体规划指导下，进一步深化各专项规划，为各专业工程建设管理提供科学依据。
（1）严格保护城市绿地空间，防止城市建设占用绿地。一般情况下，在本规划划定的绿地范围内不得进行其它开发建设活动，以保证新区良好的生态环境和空间结构。
（2）作好已批未建用地盘整工作，对长期未建用地进行回收处理，对影响基础设施重点工程建设的用地，根据规划法有关规定进行处理，对规划建成区内闲置土地制定开发计划，优先开发，提高土地利用率，以保证新区建设的有序性和土地使用的完整性。
（3）储备土地、经营土地，对新区制定相应的土地征购计划，以保证规划建设的顺利实施，并通过土地拍卖获得城市基础设施建设资金。
（1）总体规划审批后，大力加强规划立法工作，任何部门不得随意修改，以维护总体规划的严肃性。
（2）加强总体规划宣传工作，让开发商和市民都了解规划，并积极参与规划实施，对规划实施起到监督作用。